NVIDIA lansează BioNeMo Agent Toolkit pentru a accelera descoperirile științifice
NVIDIA a anunțat astăzi lansarea NVIDIA BioNeMo Agent Toolkit, care oferă instrumente și abilități specifice domeniului pentru era științelor vieții agentice.
Acest toolkit include peste un deceniu de biblioteci, instrumente și modele deschise NVIDIA pentru științele vieții, facilitând colaborarea între agenții AI, oameni de știință și laboratoare prin colectarea de dovezi, raționarea asupra constatărilor, desfășurarea experimentelor computaționale și recomandarea următorilor pași pentru a accelera descoperirea.
BioNeMo Agent Toolkit oferă oricărui agent sau platformă AI – de la asistenți generali la agenți științifici specializați, platforme software și sisteme biopharma interne – instrumentele necesare pentru a sintetiza și rezuma cunoștințele științifice, a apela modele, a evalua rezultate, a raționa și a executa acțiuni ulterioare.
Toolkit-ul include NVIDIA BioNeMo™ și este alimentat de microserviciile NVIDIA NIM™, NVIDIA Parabricks®, NVIDIA NeMo™ și NVIDIA Nemotron™, împreună cu computație accelerată și abilități – oferind o bază deschisă și de încredere pentru științele vieții agentice.
Peste 50 de companii de frunte utilizează deja acest toolkit pentru a avansa descoperirile științifice, beneficiind de abilități apelabile de agenți pentru sarcini precum predicția structurii proteinelor, docking molecular, chimie generativă, analiza genomică, designul proteinelor și descoperirea biomarkerilor.
Modelele de frontieră sunt „creierul”. BioNeMo este „cutia de unelte științifice”. Împreună, ele oferă agenților AI abilitățile unui asistent de cercetare cu doctorat și viteza unui supercomputer. Pentru prima dată, cercetătorii pot construi agenți AI care înțeleg cunoștințele științifice, folosesc instrumente științifice și execută fluxuri de lucru științifice. Aceasta reprezintă o nouă modalitate de a face știință – una care poate accelera dramatic descoperirile în biologie, chimie, genetică și medicină.”
Organizații de cercetare și modele deschise – inclusiv Arc Institute, Open Molecular Software Foundation și Institutul pentru Designul Proteinelor de la Universitatea din Washington (IPD) – colaborează cu NVIDIA pentru a utiliza BioNeMo pentru a avansa modelele de frontieră și a le face mai accesibile prin fluxuri de lucru pregătite pentru agenți. Colaborarea cu IPD a accelerat timpii de execuție pentru modelele de biodesign de vârf, precum RosettaFold3, rezultând o performanță de 2 ori mai rapidă decât modelul anterior, iar multe aplicații suplimentare pentru accelerarea eforturilor de design ale proteinelor sunt în curs de desfășurare, oferind cercetătorilor instrumente la o scară și costuri fără precedent.
„Fiecare instrument pe care l-am construit pentru designul proteinelor este la fel de puternic ca oamenii de știință care pot să îl acceseze eficient”, a afirmat David Baker. „Următorul salt în știință nu va veni dintr-o singură descoperire; va veni din viteza designurilor iterative și agenților care pot raționa repetat prin complexitatea biologiei la o viteză pe care oamenii nu o pot atinge.”
Fluxuri de lucru agentice pentru științele vieții
Științele vieții constituie una dintre cele mai importante frontiere științifice ale lumii, cu un R&D științific global ajungând la 3,8 trilioane de dolari și bugetele anuale pentru medicamente apropiindu-se de 300 de miliarde de dolari.
Fluxurile de lucru agentice pot ajuta industria să progreseze mai rapid, reducând costurile și maximizând probabilitatea de succes. Toolkit-ul permite dezvoltatorilor să transforme agenții generali în agenți pentru științele vieții în câteva minute, astfel încât cercetătorii pot desfășura experimente mai repede, învățând continuu din rezultate și închizând bucla între ipoteză și descoperire, unele companii extinzând această iterație în laboratoare fizice.
Un agent general poate avea dificultăți în a naviga eficient prin fluxurile de lucru științifice, având nevoie să deducă instrumentele corecte, intrările, ieșirile și semnificația biologică pe parcurs. Cu BioNeMo Agent Toolkit, agenții pot apela instrumentele potrivite, interpreta rezultatele mai precis și obține informații științifice mai rapid și mai fiabil.
NVIDIA optimizează întreaga platformă BioNeMo prin transformarea bibliotecilor, modelelor și cadrelor de lucru în instrumente apelabile de agenți. Aceasta include utilizarea tehnologiilor NVIDIA Agent Toolkit, cum ar fi modelele deschise NVIDIA Nemotron pentru fundamentul raționării, biblioteca NVIDIA NeMo RL pentru învățarea prin întărire și planșele NVIDIA NemoClaw™ pentru agenți siguri și privați care pot raționa pe parcursul sarcinilor, apela instrumente și interacționa continuu cu datele.
Microserviciile NVIDIA NIM ajută agenții să apeleze modele și să desfășoare sarcini. Runtime-ul NVIDIA OpenShell™ oferă un mediu executabil controlat.
Componentele toolkit-ului permit agenților să finalizeze fluxuri de lucru precum:
Screening virtual: Agenții pot ajuta cercetătorii să identifice candidați pentru medicamente prin generarea și screening-ul compușilor, docking-ul acestora la o țintă, predicția forței de legare și filtrarea după proprietăți asemănătoare medicamentelor. Apoi, agentul poate indica care candidați ar trebui să fie prioritizați, comprimând timeline-urile de screening de la zile la minute.
Analiza genomică și descoperirea țintelor: Agenții pot ajuta cercetătorii să transforme datele brute de secvențiere în informații genetice prioritizate și ținte biologice. NVIDIA Parabricks accelerează alinierea și apelarea variantelor, în timp ce modelele fundamentale genomice evaluează efectele variantelor și agentul clasifică cei mai relevanți candidați pentru boli pentru studii suplimentare.
Designul legătorilor proteici: Agenții pot ajuta cercetătorii să proiecteze și să valideze candidații computațional înainte de a începe lucrul, comprimând munca de design, care de obicei este laborioasă.
Cercetare biomedicală profundă: Agenții conectează datele din lumea reală la modelele de raționare pentru a îmbunătăți eficiența și acuratețea diverselor procese de dezvoltare științifică și clinică, inclusiv revizuirea literaturii, generarea de protocoale, screening-ul studiilor clinice și farmacovigilența prin intermediul Agentului de Cercetare Biomedical AI-Q de la NVIDIA.
Analiza imaginilor medicale: Agenții pot ajuta cercetătorii să proceseze, să segmenteze, să sintetizeze și să raționeze asupra datelor de imagistică medicală pentru a susține descoperirea biomarkerilor, accelerând generarea de dovezi în cadrul fluxurilor de lucru de cercetare.
Ecosistemul științelor vieții se dezvoltă cu NVIDIA BioNeMo
Companii din întreg ecosistemul tehnologic și al științelor vieții utilizează toolkit-ul pentru a avansa fluxurile de lucru agentice.
Laboratoarele de frontieră și constructorii de agenți științifici, inclusiv Anthropic, Edison Scientific, Lila Sciences, OpenAI și Owkin, integrează BioNeMo pentru a ajuta agenții să treacă de la a ră
