Descoperirea de noi familii de receptori pentru cancer în cadrul repertoriului imunitar al pacienților
O analiză a unei vaste colecții de date provenite din probe tumorale ale 150.000 de pacienți a condus la identificarea receptorilor T celulari împotriva cancerului, aceștia fiind comuni în rândul mai multor pacienți.
Prin prezentarea unei metode pentru descoperirea receptorilor T celulari „publici”, cercetătorii speră să accelereze eforturile de utilizare a acestor receptori în imunoterapiile destinate diferitelor tipuri de cancer. Receptorii T celulari se află în membranele celulelor T și sunt specifici pentru antigenii tumorali.
Datorită acestui aspect, receptorii T celulari reprezintă o modalitate de a viza specific celulele tumorale. Astfel, oamenii de știință consideră că acești receptori ar putea contribui la dezvoltarea unor noi terapii anticancer. Totuși, receptorii T celulari sunt extrem de diverși, iar tehnicile actuale de descoperire a receptorilor noi sunt laborioase și necesită probe de țesut greu de obținut. În acest context, Emily Jackson și colegii săi demonstrează că seturile de date publice din cohortele mari de pacienți oferă o sursă mai practică pentru descoperirea receptorilor T celulari.
Ei au construit o bază de date care include date de secvențiere RNA bulk, înregistrări clinice și lanțuri de receptori T celulari provenite de la peste 150.000 de pacienți cu mai mult de 30 de tipuri diferite de cancer avansat. Echipa a dezvoltat apoi o metodă analitică pentru a analiza cele 26 de milioane de lanțuri unice de receptori T celulari. Această abordare a descoperit receptori asociați cu antigeni tumorali comuni, cum ar fi proteina KRAS mutată și proteinele virusului papiloma uman.
Mai mult, ei au caracterizat 11 familii de receptori T celulari care erau comune în rândul mai multor populații de pacienți, inclusiv nouă familii de receptori anterior necunoscute. „În mod mai general, constatările noastre demonstrează că repertoriile imune derivate din pacienți, capturate în timpul testelor clinice de rutină, reprezintă o resursă valoroasă și în mare parte neexplorată pentru descoperirea imunoterapiilor împotriva cancerului”, concluzionează Jackson și colegii săi.
