Instrumente avansate și conducere nouă propulsează Centrul de Genomică spre noi orizonturi
Bigelow Laboratory for Ocean Sciences anunță cu entuziasm numirea unei noi conduceri, alături de instrumente inovatoare, servicii analitice și o viziune îndrăzneață pentru viitorul Centrului de Genomică la Nivel Singular (SCGC).
SCGC este în prezent singura facilitate din lume care oferă servicii și programe educaționale cu acces deschis în domeniul genomicii microbiene la nivel celular. Nicole Poulton și Julia Brown sunt acum co-directoare ale acestui centru de vârf. Poulton, care deține funcția de director al Centrului pentru Citometrie Acvatică, va întări legătura între cele două centre, sporind eficiența și reducând costurile. Brown a început cariera la Bigelow Laboratory ca primul scientist în bioinformatică al SCGC, înainte de a fi promovată în vara trecută în funcția de scientist senior în cercetare.
„Oamenii nu credeau că acest tip de muncă era posibil la început, dar am urmărit cum acest centru a evoluat dintr-o idee vagă într-o resursă uimitoare”, a declarat Poulton. „Suntem încântați să construim pe această moștenire, dar și să o extindem și să ne ducem știința în direcții noi și captivante.”
Prioritățile Brown și Poulton ca și co-directoare includ accesibilizarea serviciilor SCGC, dezvoltarea de noi parteneriate și deservirea unui număr mai mare de clienți, precum și stimularea inovației prin utilizarea unor avansuri recente și a personalului bine pregătit al centrului.
Această nouă eră a SCGC va beneficia și de instrumente recent achiziționate, care ajută echipa să împingă limitele a ceea ce este posibil din punct de vedere științific. Anul trecut, Bigelow Laboratory a primit o finanțare de 2,7 milioane de dolari din partea programului NSF’s Major Research Instrumentation pentru a achiziționa robotică nouă și un nou secvențiator, care ajută la optimizarea fluxului de lucru analitic al centrului. Această finanțare, împreună cu o donație privată generoasă, a făcut posibilă achiziția altor instrumente de vârf la Centrul pentru Citometrie Acvatică, care vor ajuta oamenii de știință să diferențieze celulele cu mai multă precizie și detaliu ca niciodată.
„Începem acest nou capitol cu un set complet de instrumente incredibile care ne vor ajuta să facem acest tip de muncă de vârf și serviciile pe care le oferim mai accesibile și mai eficiente”, a afirmat Brown. „Serviciile noastre de suport sunt foarte personalizabile și suntem deschiși să le adaptăm pentru a răspunde diferitelor nevoi de secvențiere.”
Noile instrumente permit echipei să continue unele dintre lucrările inovatoare din ultimii ani și să exploreze noi oportunități. Aceasta include o nouă abordare de genomică a microcompartimentului ambiental, publicată anul trecut, care folosește avansuri în tehnologia microfluidică pentru a crește eficiența și capacitatea de procesare a secvențierii la nivel celular. Scientistul senior în cercetare Melody Lindsay va colabora cu SCGC pentru a aplica această tehnică în ecosisteme cu foarte puțin biomasa, studiind modul în care celulele individuale pot funcționa pe baza planului lor genomic, o provocare fundamentală în microbiologie.
La sfârșitul acestei luni, scientistul senior în cercetare John Burns va colabora, de asemenea, cu SCGC și Centrul pentru Citometrie Acvatică pentru a secvenția primul genom de radiolarian, cu ajutorul unei noi finanțări de bază. Acești protisti marini formează schelete din sticlă intricate, care au intrigat exploratorii oceanici de-a lungul timpului, dar cunoștințele de bază despre istoria lor de viață au fost evazive pentru oamenii de știință; genomică la nivel celular ar putea oferi calea pentru a decodifica aceste creaturi enigmatice.
„Proiectele ca acestea evidențiază căile creative pe care le putem explora, profitând de expertiza pe care o avem în instituția noastră”, a spus Poulton.
Brown și Poulton sunt entuziasmate să exploreze alte modalități de extindere a utilizării tehnologiei SCGC în cercetare. Aceasta ar putea include integrarea unor fluxuri de date suplimentare în analizele lor și aplicarea secvențierii la nivel celular pentru a studia noi sisteme, cum ar fi microbiomul uman. De asemenea, se așteaptă să dezvolte noi instrumente de bioinformatică și să valorifice AI pentru a îmbunătăți datele genomice produse de centru și a descoperi noi tipare și relații în lumea microbiană.
În continuare, centrul va continua să creeze noi servicii și să facă datele mai accesibile. O parte importantă a acestui efort, au declarat co-directoarele, este reducerea costurilor și a barierelor de intrare pentru a facilita știința „în orice formă sau formă de care oamenii au nevoie”, inclusiv sprijinul clienților cu nevoi sau proiecte specifice în faza exploratorie sau pilot. Un obiectiv conex este reluarea simpozionului de genomică la nivel celular pentru a construi ecosistemul utilizatorilor și partenerilor SCGC și a completa cursurile de dezvoltare profesională existente oferite de SCGC și Centrul pentru Citometrie Acvatică.
„Este totul parte din viziunea noastră de a educa comunitatea și de a ne asigura că datele și serviciile noastre sunt mai disponibile și mai accesibile”, a afirmat Brown. „Avem echipamente extraordinare. Avem o echipă fantastică. Am stabilit metodologii de vârf. Suntem deschiși pentru a vă ajuta să descoperiți ce poate face genomică la nivel celular pentru dumneavoastră.”
