Un set de date COVID-19 recent disponibil sprijină cercetarea clinică reproducibilă
Unitatea de Biostatistică de la Institutul de Cercetare Germans Trias i Pujol (IGTP), în colaborare cu cercetători din diverse instituții de sănătate și cercetare din Catalonia, a publicat baza de date a studiului DIVINE în revista Scientific Data, parte a Nature Portfolio.
Această cohortă include informații clinice de la 5,813 pacienți spitalizați cu COVID-19 în timpul a patru valuri ale pandemiei, între martie 2020 și august 2021, în cinci spitale din zona metropolitană sudică a Barcelonei. Baza de date conține date colectate în timpul spitalizării și follow-up, incluzând caracteristici clinice, factori de risc, tratamente primite și rezultate spitalicești.
Datele au fost publicate sub formă de pachet R pe CRAN, având un depozit asociat pe GitHub și un record Zenodo, facilitând accesul, trasabilitatea și reutilizarea. Datasetul a fost anonimizat și poate fi utilizat pentru a studia evoluția pacienților spitalizați cu COVID-19, identificarea factorilor asociați cu rezultatele clinice și validarea modelelor predictive. De asemenea, poate servi ca resursă didactică în domenii precum biostatistica și epidemiologia.
Cohorta a contribuit deja la mai multe studii privind mortalitatea în spital, sechelele pe termen lung, stratificarea pacienților și dezvoltarea modelelor predictive. Prin această publicație, autorii își propun să pună baza de date la dispoziția comunității științifice pentru a facilita reutilizarea acesteia în studii viitoare și a contribui la o cercetare mai deschisă, reproducibilă și eficientă.
Cristian Tebé, șeful Unității de Biostatistică de la IGTP, subliniază că „facerea disponibilă a datelor de cercetare clinică este nu doar un act de transparență, ci și un angajament etic față de știință și societate. Aceasta permite reutilizarea datelor, reproducerea analizelor, extinderea cunoștințelor și accelerarea cercetării, evitând totodată duplicarea inutilă a studiilor”.
Cohorta DIVINE este rezultatul unei colaborări între clinicieni, cercetători și biostatisticieni din mai multe instituții sanitare și academice din Catalonia. Proiectul a început în timpul primului val al pandemiei, cu crearea unui sistem de colectare a datelor de către Serviciul de Boli Infecțioase de la Spitalul Universitar Bellvitge și biostatisticienii de la Institutul de Cercetare Biomedică Bellvitge (IDIBELL), fiind ulterior extins prin participarea altor instituții. Cercetători de la IGTP, Spitalul Universitar Bellvitge, Universitatea Politehnică din Catalonia, Universitatea din Barcelona, Consorci Sanitari Integral, Consorci Sanitari Alt Penedès Garraf, Spitalul Viladecans, Institutul Parc Sanitari Sant Joan de Déu pentru Cercetare și Inovare în Științele Vieții și Sănătății din Centrul Cataloniei și CIBER în Boli Infecțioase au participat la această muncă, reprezentând grupurile MetroSud și DIVINE.
