Un test inovator identifică cauza genetică a bolii musculare ereditare
Un test de pionierat dezvoltat de cercetători de la Garvan Institute of Medical Research a reușit să identifice cauza genetică a bolilor musculare ereditare la persoane care nu au primit răspunsuri timp de ani, uneori chiar decenii, în urma testărilor standard.
Studiul publicat în Nature Communications a aplicat testul pe 53 de australieni cu boli musculare ereditare cunoscute sau suspectate, inclusiv 31 de persoane ale căror testări genetice anterioare nu reușiseră să identifice o cauză. Peste o treime dintre aceste cazuri nerezolvate au primit un diagnostic prin intermediul noului test. În medie, participanții au trăit fără răspunsuri la simptomele lor timp de 14 ani.
Boli musculare ereditare, cum ar fi distrofia musculară, afectează aproximativ 6.000 de australieni. Acestea determină slăbirea și degradarea treptată a mușchilor, adesea privând persoanele afectate de capacitatea de a merge, de a înghiți, de a vorbi clar sau de a folosi mâinile. Aceste afecțiuni pot începe în copilărie sau la vârsta adultă, se agravează în timp și, în prezent, nu există tratamente disponibile.
Noul test utilizează secvențierea nanoporelor cu citire lungă, o tehnologie recentă care poate citi secvențe de ADN mult mai lungi decât metodele standard și poate detecta modificări genetice complexe pe care testele mai vechi le omit frecvent. În cadrul unui singur experiment, testul analizează peste 300 de gene cunoscute ca fiind implicate în bolile musculare ereditare și identifică întreaga gamă de modificări ADN care le stau la bază.
Mulți dintre bolile musculare nu au teste genetice disponibile, iar pentru altele există câte un test separat pentru fiecare genă implicată. „Aici am arătat că este posibil să testăm toate genele simultan, ceea ce reprezintă o schimbare radicală pentru cei care au trecut prin ani de teste inconcludente”, afirmă Dr. Ira Deveson, șef de laborator la Garvan și coautor senior al studiului.
De ce atât de multe persoane rămân nediagnosticate? Testele standard de diagnostic pentru bolile musculare ereditare caută un anumit tip de modificare ADN la un moment dat, dar aceste afecțiuni pot fi cauzate de numeroase modificări genetice. Unele implică erori de o literă în codul ADN, altele se referă la secțiuni mari lipsă sau duplicate, expansiuni instabile ale secvențelor repetate sau marcaje chimice „epigenetice” care activează sau dezactivează gene. Până acum, nu exista un test unic care să poată detecta toate aceste modificări simultan, o lacună pe care secvențierea cu citire lungă o închide.
Noi cauze genetice ale bolilor musculare sunt în continuare identificate, iar fiecare dintre acestea necesită timp pentru a fi integrate într-un test clinic acreditat, ceea ce înseamnă că mulți oameni afectați de condiții recunoscute în ultimii cinci până la zece ani nu pot fi diagnosticați. Noul test le acoperă pe toate, în timp ce detectează variante cunoscute de mai mult timp.
Pentru unii dintre participanți, noul test a identificat o variantă genetică pe care niciun test clinic australian nu o analizează în prezent. Pentru alții, a corectat un diagnostic greșit.
Indiferent de situație, rezultatele au consecințe semnificative, afirmă asociatul profesor Kishore Kumar, lider de grup la Garvan și neurolog la Concord Repatriation General Hospital. „Un diagnostic genetic confirmat schimbă consilierea pe care o putem oferi familiilor, deschide accesul la sprijin, cum ar fi National Disability Insurance Scheme, determină monitorizarea unor complicații, cum ar fi problemele cardiace, și permite oamenilor să se înscrie în studii clinice care necesită o cauză genetică cunoscută. Fără aceasta, multe dintre aceste uși rămân închise. Acest nou test plasează Australia în fruntea diagnosticării genetice, iar alte țări vor urma.”
Dr. Dennis Yeow, neurolog și doctorand la Universitatea din Sydney, care a co-condus studiul, subliniază impactul asupra indivizilor. „Unii pacienți căutau o explicație pentru simptomele lor de mai bine de un deceniu, supunându-se unor investigații repetate, inclusiv analize de sânge, scanări RMN, studii neurofiziologice și chiar biopsii musculare. Capacitatea de a le oferi în sfârșit un nume pentru ceea ce au este semnificativă, atât pentru ei, cât și pentru familiile lor.”
Echipa lucrează acum cu Laboratorul de Medicină Moleculară al NSW Health Pathology de la Concord Hospital pentru a introduce testul în îngrijirea de rutină. Cercetătorii estimează că acesta ar putea fi disponibil în întreaga Australie în aproximativ doi ani.
Dr. Andre Reis, ofițer de cercetare senior la Garvan și bioinformatician principal al studiului, a construit o mare parte din cadrul analizei care face testul aplicabil în context clinic. „Secvențierea cu citire lungă generează o cantitate uriașă de informații complexe despre ADN-ul unei persoane. Am transformat asta în rezultate clare și fiabile pe care un laborator de diagnostic le poate utiliza. Asta face tranziția de la o tehnică de cercetare la ceva care poate ajuta cu adevărat oamenii”, afirmă el.
Deși studiul s-a concentrat pe bolile musculare, aceeași abordare a testului ar putea fi aplicată și altor condiții ereditare rare.
„Tehnologia cu citire lungă pe care am aplicat-o în acest test este agnostică față de boală”, spune Dr. Deveson. „Ceea ce am demonstrat pentru bolile musculare ar putea fi, în timp, extins la multe dintre condițiile genetice rare pentru care oamenii petrec în prezent ani căutând un nume pentru ceea ce au. Aceasta este direcția în care dorim să ne îndreptăm.”
