O analiză inovatoare relevă modificări genetice unice în cazul pacienților cu cancer
Cercetările recente, prezentate astăzi la conferința anuală a Societății Europene de Genetică Umană, subliniază influența semnificativă a ancestralei genetice asupra evoluției bolii și a supraviețuirii pacienților cu cancer.
În cel mai amplu studiu de acest gen, cercetătorii au analizat aproape 1.900 de modificări genetice specifice în tumori pentru a determina dacă anumite mutații sunt mai frecvente în rândul pacienților cu origini geografice istorice diferite.
Dr. Yixuan He, profesor asistent de epidemiologie la Universitatea de Științe ale Sănătății din Texas, a colaborat cu studenta sa de doctorat, Jiawei Tu, pentru a analiza datele de secvențiere genetică provenite de la peste 30.000 de pacienți din două mari centre oncologice: Dana-Farber din Boston, Massachusetts, și MD Anderson din Houston. Datele au inclus cinci tipuri diferite de cancer: sân, colorectal, gliom (cel mai comun tip de cancer cerebral), pancreas și plămâni.
Pe lângă analiza mutațiilor, cercetătorii au considerat și statutul socioeconomic și factorii de poluare a mediului pentru a evita distorsionarea rezultatelor. Ulterior, au creat un sistem de evaluare bazat pe mutațiile genetice pentru a prezice care pacienți ar putea avea o supraviețuire mai scăzută din cauza cancerului, testând în același timp dacă informațiile despre ancestră îmbunătățesc predicția.
Deși scorurile de predicție au fost realizate anterior, aceasta este prima analiză de o asemenea amploare.
Studiile anterioare s-au limitat la grupuri mici dintr-o singură populație și o singură tumoare, adesea fără a lua în considerare factorii de mediu sau rezultatele clinice pe termen lung. Prin extinderea domeniului de cercetare, cercetătorii și-au propus să demonstreze impactul real și măsurabil al ancestralei genetice asupra genomicii cancerului și rezultatelor clinice.
Rezultatele au arătat zeci de mutații care erau semnificativ mai frecvente sau mai rare în funcție de ancestră, aproximativ jumătate dintre acestea putând fi vizate de tratamente existente. Sistemul de evaluare a fost capabil să prezică supraviețuirea pacienților, în special în cazurile de cancer mamar și gliom. Atunci când informațiile despre ancestră au fost incluse, predicția supraviețuirii a devenit și mai precisă, în special în cazul cancerului de pancreas.
Secvențierea tumorilor este într-o continuă expansiune în îngrijirea modernă a cancerului, iar ancestrala genetică poate fi estimată din aceste date, astfel că integrarea ei nu ar implica costuri sau teste suplimentare. Factorii de mediu pot fi, de asemenea, estimați simplu, în funcție de locul în care locuiește pacientul.
„Provocarea integrării nu ar veni din lipsa tehnologiei adecvate, ci dintr-un flux de lucru care să permită derivarea acestor factori importanți din colectarea de date de rutină existente”, afirmă Dr. He. „Colaborăm în prezent cu oncologi în speranța de a depăși aceste bariere.”
Cercetătorii intenționează acum să-și extindă analizele pentru a include alte tipuri de cancer și pentru a integra factori de mediu suplimentari, precum fumatul și alți poluanți, colaborând ideal cu alte grupuri pentru a reproduce aceste descoperiri în alte cohorte de pacienți.
Deși unele dintre concluziile lor erau deja cunoscute, au reușit să identifice și mai multe asocieri noi, de exemplu, supra-reprezentarea unui gen implicat în controlul proliferării celulare (CDK6) la pacienții cu cancer mamar afro-americani și pierderea SMAD2, un alt gen de control al proliferării celulare, la pacienții americani cu cancer colorectal cu o ancestră mixtă.
„A fost foarte încurajator să vedem semnale legate de ancestră replicate între cele două biobănci diferite, în ciuda diferențelor geografice și de populație. Prin identificarea unor markeri genetici specifici legați de ancestră, putem identifica mutații vizate pentru a ajuta medicii să utilizeze tratamente cu rezultate mai bune în supraviețuire. Validând aceste semnale în diverse populații, ne asigurăm că un anumit tratament este adaptat și eficient pentru o gamă diversă de pacienți”, încheie Dr. He.
Președintele conferinței, profesor Alexandre Reymond, care nu a fost implicat în cercetare, a declarat: „Acest studiu arată convingător necesitatea de a evalua riscurile bolii în populații diverse, dacă dorim să personalizăm complet medicina și să ajutăm un număr maxim de pacienți.”