Anticorpii de cercetare insuficient validați conduc la risipirea a milioane de mostre
Un deficit generalizat în validarea anticorpilor de cercetare înainte de utilizare ar putea genera risipa evitabilă a milioane de mostre de țesuturi animale și umane la nivel mondial, iar un grup internațional de experți a ajuns la un consens privind soluționarea acestei probleme, conform a două studii publicate pe 6 octombrie în revista PLOS Biology de Harvinder Virk de la Universitatea din Leicester, Regatul Unit, și colegii săi.
Anticorpii sunt reactivi esențiali care permit cercetătorilor să detecteze, să cuantifice și să izoleze proteine specifice în eșantioane biologice. Totuși, anticorpii de cercetare nu se leagă întotdeauna de țintele dorite sau pot interacționa cu ținte suplimentare nedorite. Studiile sugerează că mulți anticorpi nu se leagă conform așteptărilor, iar această lipsă de specificitate poate direcționa greșit cercetarea biomedicală în diverse domenii.
În primul studiu, Virk și primul autor Michael Biddle au combinat date din grupuri de discuții (12 cercetători), un sondaj (107 cercetători) și o analiză a 785 de publicații legate de anticorpi care nu au trecut testarea rigoros, controlată prin knockout. Dintre cele 760 de publicații pentru care s-a putut determina statutul de validare, doar 120 (15,8%) au prezentat dovezi de validare, în ciuda faptului că 72,0% dintre cercetătorii chestionați au raportat că au utilizat cel puțin o metodă de validare recomandată. Publicațiile fără validare a anticorpilor au utilizat un minim de 8.064 de mostre animale și 4.424 de mostre de țesut uman. Extrapolând, cercetătorii estimează că milioane de mostre de țesuturi animale și umane au fost consumate la nivel global fără o validare adecvată.
„Acest studiu oferă, după cunoștințele noastre, prima cuantificare sistematică a risipei de mostre biologice atribuibilă utilizării anticorpilor cu performanțe slabe fără validare specifică pentru context”, afirmă cercetătorii.
În al doilea studiu, Virk și prima autoare Katherine Blades au reunit 32 de experți internaționali – inclusiv cercetori, editori, finanțatori, producători de anticorpi și lideri instituționali – pentru un exercițiu de consens Delphi în două etape, destinat evaluării reformelor propuse pentru validarea anticorpilor. Panelul a convenit că 15 acțiuni, inclusiv formarea instituțională, bugete dedicate pentru validare în aplicațiile de granturi și cerințe de raportare din partea editorilor, sunt atât eficiente, cât și realizabile până în 2030; alte 15 acțiuni au fost considerate eficiente, dar cu fezabilitate incertă. Participanții au subliniat că lipsa unei proprietăți clare asupra problemei și stimulentele de piață care nu recompensează calitatea anticorpilor sunt bariere importante.
„Constatările se pretează la un program de consultare țintită a părților interesate”, spun autorii. „Pentru a sprijini acest lucru, am pregătit documente separate pentru fiecare grup de părți interesate – editori, finanțatori, instituții și producători – prezentând recomandările consensuale împreună cu opțiuni de implementare derivate din feedback-ul calitativ al panelului. Acestea prezintă opțiuni mai degrabă decât prescripții, recunoscând că abordarea optimă va varia în funcție de organizații, țări și contexte.”
Virk menționează: „Acum aproximativ zece ani, am descoperit că datele pe care le-am trimis într-o aplicație de grant se bazau pe un anticorp care nu detecta ținta dorită. Datele includeau colorarea biopsiilor bronhiale de la pacienți care au dat consimțământ informat. Aceștia nu s-ar fi așteptat ca donația lor să fie irosită. Aceasta a fost motivația care a condus această lucrare.”
Biddle adaugă: „Cercetătorii ne-au spus că validează anticorpii lor: 72% au raportat utilizarea cel puțin a unei metode recomandate. Dar doar 120 din cele 760 de lucrări pe care le-am putut evalua au arătat vreo dovadă de validare. Celelalte 640 de studii au raportat utilizarea a cel puțin 8.064 de mostre animale și 4.424 de mostre de țesut uman cu anticorpi care nu au trecut testarea independentă; descriem aceste mostre ca fiind în pericol de risipă. În cele mai clare cazuri – unde anticorpul a fost retras de la vânzare, astfel încât lucrările nu pot fi replicate deloc – estimarea globală minimă pe baza pieței comerciale de anticorpi indică între 4 și 7 milioane de mostre animale și între 6 și 11 milioane de mostre de țesut uman.”
Blades afirmă: „Ceea ce ne-a impresionat a fost nivelul de acord odată ce cercetătorii, finanțatorii, editorii, instituțiile și producătorii au fost implicați în același proces. Panelul a ajuns la consens asupra a 15 acțiuni care sunt atât eficiente, cât și realizabile până în 2030. Progresul este împiedicat nu de dezacorduri privind ceea ce trebuie făcut, ci de faptul că nicio grupare nu deține problema – astfel încât toată lumea așteaptă ca altcineva să se miște primul.”
Virk subliniază: „Împreună, aceste lucrări arată că problema are un impact semnificativ cu dimensiuni etice și este soluționabilă. De când am finalizat această lucrare, am integrat campioni pentru o practică mai bună în 14 instituții de cercetare din Regatul Unit, iar Universitatea din Leicester a făcut ca formarea pentru validarea anticorpilor să fie obligatorie pentru cercetătorii săi de masterat în biosciențe. Colaborăm cu doi finanțatori naționali – NC3Rs și Cancer Research UK – pentru soluții de implementare și am creat instrumente gratuite pe care editorii le pot utiliza pentru a proteja integritatea a ceea ce publică.”
