Biognosys dezvăluie inovații multiomice de generație viitoare la ASMS 2026
Grupul Biognosys, lider în domeniul multiomicelor bazate pe spectrometria de masă, anunță progrese semnificative în cadrul portofoliului său integrat de multiomics, evidențiind software-ul de generație următoare, tehnologii de pregătire a probelor, îmbogățire și separare pentru proteomică și metabolomică.
Lansarea Spectronaut 21 și SpectroMine 6, continuarea inovației în teste țintite ultrasensibile și fluxuri de lucru optimizate, inclusiv iST-S, îmbogățirea cu particule unice P2, fluxurile de lucru pentru țesuturi FFPE și soluțiile PepSep nanoLC, îmbunătățesc sensibilitatea, reproducibilitatea și capacitatea de procesare, permițând profilarea moleculară de înaltă calitate la scară largă pentru aplicații de descoperire, cercetare translatională și clinică.
Spectronaut 21 și SpectroMine 6 stabilesc noi repere în proteomica DIA și DDA: Spectronaut 21 crește ratele de identificare cu aproximativ 10% mai multe grupuri de proteine pe un grup de 65 de seturi de date proteomice și cu aproximativ 11% mai multe peptide pe un grup de 27 de seturi de date immunopeptidomice, datorită avansurilor în directDIA, predicția parametrelor PTM rare conduse de inteligența artificială, îmbunătățirea localizării și stoichiometriei PTM, eficiență computațională îmbunătățită cu până la 15% pentru procesarea datelor directDIA și noi caracteristici centrate pe utilizator pentru fluxurile de lucru PTM și etichetare.
Yansheng Liu a declarat: „Spectronaut este software-ul nostru preferat pentru analiza DIA datorită performanței sale ridicate și a interfeței prietenoase cu utilizatorul, ceea ce face ca analiza seturilor noastre de date DIA complexe și multiplexate să fie atât ușoară, cât și de încredere.”
Prof. Dr. Matthias Mann a spus: „Spectronaut este un excelent supliment la capabilitățile noastre informatice, în special pentru analiza detaliată a datelor DIA pe scară largă a fosfopeptidelor și algoritmul avansat de localizare a modificărilor.”
Biognosys și SISCAPA Assay Technologies colaborează pentru a avansa proteomica țintită ultrasensibilă pentru aplicații de cercetare clinică: parteneriatul combină expertiza Biognosys în proteomică și analiza datelor cu îmbogățirea anticorpilor pe peptide a SISCAPA pentru cuantificarea absolută a proteinelor cu sensibilitate ridicată. Un test ultrasensibil pentru cuantificarea nivelurilor proteinei UBE3A în lichidul cefalorahidian uman sprijină monitorizarea cercetării terapeutice la pacienții cu sindrom Angelman. Acest lucru evidențiază potențialul proteomicii țintite de a permite măsurători precise și utile clinic ale biomarkerilor.
Oliver Rinner a comentat: „Dezvoltarea clinică necesită nu doar abordări terapeutice promițătoare, ci și instrumente fiabile pentru a măsura dacă acele terapii au efectele dorite. Prin combinarea expertizei Biognosys în proteomica cantitativă de înaltă sensibilitate cu cadrul LITE al MJFF, ne propunem să accelerăm dezvoltarea biomarkerilor care pot ghida dezvoltarea medicamentelor pentru Parkinson și să reducem riscurile în studiile clinice.”
iST-S permite proteomica profundă, reproducibilă și la înaltă capacitate din probe de intrare ultra-scăzute: Biognosys prezintă iST-S, o extensie optimizată a fluxului de lucru PreOmics iST, care permite o adâncire robustă a proteomicii din probe de sub-microgram. Tehnologia optimizată iST-S oferă o adâncire proteomică accesibilă și extrem de reproducibilă din materiale de început de până la 0,5 µg. Benchmarking-ul intern efectuat pe diverse platforme LC-MS, inclusiv timsTOF HT și Orbitrap Astral, demonstrează identificarea constantă a aproximativ 7.500 de grupuri de proteine din 0,5–10 µg de probe din celulele HeLa și HEK293. Este important de menționat că proprietățile fizico-chimice ale peptidei sunt păstrate, asigurând detectarea fiabilă a proteinelor precum CDK9, HDAC1 și ERBB2 chiar și la cele mai scăzute niveluri de intrare.
În rândul liniilor de celule canceroase utilizate frecvent, iST-S permite identificarea a până la 10.000 de proteine cu o reproducibilitate ridicată (CV ~10%), subliniind adecvarea sa pentru proteomica standardizată la intrare scăzută și aplicații de screening la scară largă.
Îmbunătățirea îmbogățirii cu particule unice P2 extinde acoperirea profundă a proteomului la probele de ser: Biognosys prezintă noua îmbogățire cu particule unice P2, optimizată pentru ser și matrice alternative de plasmă, extinzând performanța îmbogățirii bazate pe coroana de proteine dincolo de plasma EDTA. P2 valorifică formarea coroanei de proteine pe o singură particulă inginerizată pentru a permite îmbogățirea reproducibilă și la înaltă capacitate într-un format de bine unic. Comparativ cu kitul original P2-iST și măsurători fără tratament, fluxul de lucru optimizat demonstrează o creștere de până la 4 ori a ID-urilor de proteine în ser și plasma heparinică, cu o performanță cantitativă robustă. Experimentele de linearitate arată o corelare excelentă (R² de până la ~0,97–0,98) pe nivelurile de spike-in, sprijinind cuantificarea fiabilă. În plus, fluxul de lucru P2 arată robustețe pe plăci, loturi, laboratoare și metode de colectare a sângelui, subliniind adecvarea sa pentru studiile clinice de proteomică la scară largă.
Un studiu independent recent (Völlmy et al., Journal of Proteome Research 2026) a raportat prima comparație directă evaluând performanța cantitativă a diferitelor tehnologii pentru îmbogățirea proteomică profundă a plasmei. Tehnologiile de îmbogățire pe bază de minge au depășit fluxurile de lucru de depletion bazate pe anticorpi în adâncimea proteomică, în timp ce ENRICH iST, folosind doar 20 µL de material de intrare, menține o corelație mare cu plasma neatinsă (r ≈ 0,7), sugerând că profilurile de abundență relativă ale proteinelor plasmatice nu sunt substanțial modificate. Noua tehnologie P2 a realizat cea mai mare adâncime (~4.040 de proteine la 50 µL de material de intrare), cu un CV median de 18,4%. Autorii au raportat că măsurătorile proteinelor annotate ca secretate nu au fost semnificativ afectate, permițând cuantificarea fiabilă a proteinelor plasmatice biologic relevante.
Markku Varjosalo a afirmat: „La Helsinki Proteomics Center, am evaluat practic toate strategiile principale de depletion/îmbogățire a plasmei disponibile pe piață. Când adâncimea contează, P2-iST iese întotdeauna în evidență. Pentru noi, a fost un schimbător de joc – pune proteomica profundă și robustă a plasmei la dispoziția oricărui laborator fără hardware costisitor și proprietar. Reproducibilitatea și adâncimea cu P2-iST o fac ideală pentru studiile clinice și translatională de dimensiuni medii.”
Carina Sihlbom Wallem a spus:
