Fumatul nu influențează semnificativ microbiomul ocular, conform unui studiu mic
Deși fumatul are efecte cunoscute asupra altor comunități microbiene, acest studiu sugerează că ecosistemul de pe suprafața oculară ar putea rămâne surprinzător de stabil, lăsând deschisă posibilitatea unor schimbări mai mici care ar putea fi detectate de studii mai ample.
Un studiu recent publicat în jurnalul Scientific Reports a evaluat, la Universitatea din Bern, Elveția, dacă fumatul este asociat cu modificări în microbiomul suprafeței oculare și proteomele lacrimale, comparând compoziția microbiană, diversitatea și profilele funcționale, precum și proteinele lacrimale, între fumători și nefumători.
Știați că fumatul de tutun poate afecta comunitățile microbiene din întregul corp, dar influența sa asupra ochilor rămâne în mare parte necunoscută?
Microbiomul ocular este o comunitate de bacterii, viruși, fungi și alte eucariote cu biomasă scăzută, care poate sprijini sănătatea oculară prin modularea răspunsurilor imune locale, menținerea integrității barierei epiteliale și limitarea colonizării de către patogeni. Când acest echilibru este perturbat, pot apărea afecțiuni precum sindromul ochiului uscat, conjunctivita și keratita.
Fumatul este cunoscut ca un factor de risc important pentru dezvoltarea diferitelor boli oculare, dar efectul specific al fumatului asupra microbiomului suprafeței oculare nu a fost explorat sistematic.
În cadrul studiului, cercetătorii au recrutat 41 de adulți din cadrul Departamentului de Oftalmologie al Spitalului Universitar din Bern, Elveția, incluzând 17 fumători și 24 de nefumători. Fumătorii consumau cel puțin șase țigări pe zi timp de minimum doi ani, în timp ce nefumătorii nu aveau o istorie documentată de utilizare a tutunului.
Probe au fost colectate pe parcursul iernii, primăverii și verii, după obținerea consimțământului informat. Fluidul lacrimal a fost colectat folosind testul lacrimal Schirmer tip I, iar tampoanele conjunctivale din ambele ochi au fost prelevate pentru analiza microbiomului. Au fost incluse controale pozitive și negative pentru a asigura calitatea datelor.
ADN-ul microbian extras din tampoanele conjunctivale a fost supus secvențierii metagenomice shotgun pentru a identifica comunitățile bacteriene, fungice și virale, după eliminarea secvențelor umane și a contaminanților. Au fost efectuate și analize funcționale microbiene, inclusiv profiluri de familii genice și căi metabolice.
Probe de lacrimi au fost analizate cu ajutorul cromatografiei lichide nano-cromatografice cu masă în tandem pentru a determina profilul lor proteomic. Analizele statistice au inclus evaluări ale diversității alpha și beta, analiza coordonatelor principale (PCoA), analiza multivariată permutativă a varianței (PERMANOVA), analiza abundenței diferențiale, analiza componentelor principale (PCA) și analiza expresiei diferențiale cu corecție pentru testarea multiplă. Analizele de putere post-hoc au fost de asemenea realizate pentru a estima capacitatea de a detecta diferențe semnificative între grupurile studiate.
Un total de 41 de probe de tampoane conjunctivale au fost secvențiate, inclusiv 24 de la nefumători și 17 de la fumători. Nu s-au observat diferențe semnificative între grupuri în ceea ce privește vârsta sau sexul.
După decontaminarea cu ajutorul pipeline-ului microDecon, Actinobacteria (59,1%), Proteobacteria (25,8%) și Firmicutes (13,9%) au constituit principalele grupuri bacteriene la nefumători, în timp ce Proteobacteria (43,2%), Actinobacteria (35,6%) și Firmicutes (20,7%) au fost cele predominante în rândul fumătorilor.
În general, Cutibacterium acnes a avut cea mai mare abundență relativă atât la nefumători (52,1%), cât și la fumători (30,7%), în timp ce Moraxella osloensis a reprezentat 20,9% și 30,6%, respectiv. Limosilactobacillus fermentum și Sphingobium yanoikuyae au fost, de asemenea, frecvent detectate.
Printre eucariote, atât Basidiomycota, cât și Ascomycota au fost grupurile predominante. În special, Basidiomycota a constituit 51,0% din prezența eucariotică la nefumători și aproximativ 64,1% la fumători, în timp ce Ascomycota a reprezentat 49,0% și 35,9%, respectiv.
Saccharomyces cerevisiae a fost cea mai prevalentă specie eucariotică, contând pentru 44,9% și 27,3%, respectiv, în timp ce Malassezia globosa a fost a doua cea mai frecvent întâlnită specie, având 25,8% și 27,7%, respectiv.
În plus, Cryptococcus neoformans a contribuit cu 18,0% și 23,1% din prezența eucariotică în ambele grupuri. În cele din urmă, au existat câteva variații în cadrul comunităților virale. Deoarece anotările la nivel de filum nu erau disponibile pentru setul de date viral, cercetătorii au examinat comunitățile virale la nivel de ordin.
Ordinele virale cele mai frecvent întâlnite au inclus viruși neclasați, Caudovirales și Herpesvirales. Rezultatele au relevat, de asemenea, secvențe atribuite virusului Glypta fumiferanae (21,3% la nefumători; 14,3% la fumători), herpesvirusului Ictalurid 1 în ambele grupuri (11,1%) și virusului BeAn 58058 (8,7% la nefumători; 15,8% la fumători).
Analizele de diversitate bacteriană nu au indicat diferențe semnificative între grupurile de fumători și nefumători. Indicele mediu de diversitate Shannon pentru bacterii a fost de 0,89 la nefumători și 0,81 la fumători (p = 0,5235).
Indicele de diversitate alpha pentru eucariote nu a arătat diferențe semnificative între cele două grupuri (p = 0,369), în timp ce diversitatea alpha virală a rămas similară între grupuri (p = 0,83). Rezultatele PCoA au demonstrat că comunitățile bacteriene, eucariote și virale nu s-au grupat distinct. PERMANOVA a arătat, de asemenea, că nu există diferențe semnificative pentru bacterii (R2 = 0,052; p = 0,106), eucariote (R2 = 0,034; p = 0,488) sau viruși (R2 = 0,035; p = 0,175).
Analiza abundenței diferențiale nu a identificat taxa bacteriană, eucariotică sau virală care să difere semnificativ după corectarea pentru testarea multiplă. Totuși, o caracteristică la nivel de gen bacterian a fost raportată ca diferită între grupuri, sugerând că absența diferențelor taxonomice semnificative nu ar trebui extinsă la toate caracteristicile funcționale microbiene.
Analiza de putere post-hoc a arătat constant o putere observată scăzută în comparațiile diversității alpha bacteriene, fungice și virale. Autorii au atenționat că rezultatele ar trebui interpretate ca dovezi împotriva unui efect mare asociat
