O nouă metodă îmbunătățește etichetarea interacțiunilor proteinelor în celulele canceroase
O echipă de cercetare de la Universitatea Cornell a dezvoltat o strategie pentru capturarea interacțiunilor dintre proteinele specifice cancerului, ceea ce ar putea conduce la terapii țintite pentru forme mortale de cancer, precum cel de prostată, cancerul pulmonar cu celule mici și cancerul pancreatic.
Focalizându-se pe moleculele care înconjoară și susțin proteina c-Myc, esențială pentru creșterea tumorilor, echipa condusă de Ciaran Seath a descoperit o modalitate de a caracteriza această proteină într-un context exclusiv canceros. Aceștia au identificat că proteina este reglată în cancer prin intermediul unei proteine de semnalizare numită SLK, care este prezentă atât în celulele sănătoase, cât și în cele canceroase, la concentrații similare, astfel că a fost în mare parte ignorată de comunitatea biomedicală.
„În loc să ne concentrăm pe nivelurile proteinelor, ne axăm pe localizarea lor. Am identificat ceva cu adevărat vital pentru această serie de cancere să crească și să prolifereze, ceea ce deschide un întreg domeniu”, a declarat Seath.
Seath este autor corespondent al studiului „Etichetarea prin fotoproximitate a c-Myc dezvăluie SLK ca un co-regulator specific cancerului”, publicat pe 13 august în Nature Chemical Biology.
Laboratorul lui Seath a adaptat o metodă de etichetare la scară nanometrică, numită „µMap” (MicroMap), care permite o etichetare mai precisă a interacțiunilor dintre proteinele care au loc în celulele specifice cancerului, inclusiv cele care implică c-Myc, un factor de transcripție care controlează creșterea celulară și este deregulat în aproape jumătate dintre toate cancerele.
Pentru acest studiu, echipa a atașat antene chimice pe proteinele c-Myc din trei linii celulare de prostată, reprezentând prostată sănătoasă, cancer de prostată AR-negativ și cancer de prostată AR-pozitiv. Comparând cele trei „interactome”, au descoperit mai mulți parteneri comuni, dar corelarea acestora cu baza de date DepMap a evidențiat SLK ca o proteină de interes în cancerul de prostată AR-negativ.
O analiză mai detaliată a SLK în acest context a arătat că localizarea sa în celulă era complet diferită – în nucleu, ceea ce îi permitea să stabilizeze c-Myc.
„Când ai acest factor de transcripție care poate avea de 10, 20 sau 30 de ori mai mult decât proteina sa normală, poate începe să interacționeze cu lucruri cu care nu ar trebui să o facă. Odată ce identificăm aceste complexe noi, le putem folosi ca un punct de plecare pentru a trata boala fără a afecta celulele sănătoase. Utilizând µMap, am reușit să examinăm foarte precis acele interactome, acele ‘vecinătăți’ în boală”, a spus Seath.
Tehnica lor de etichetare precisă identifică SLK ca un factor de conducere al cancerului, dar doar în anumite contexte. Celulele sănătoase pot folosi acest SLK nuclear pentru a regenera țesut – un exemplu fiind pielea arsă de soare, a adăugat Seath. Însă celulele canceroase își însușesc abilitatea regenerativă a SLK pentru a impulsiona creșterea.
Seath a menționat că lucrările sunt în curs de desfășurare în laboratorul său pentru a dezvolta molecule terapeutice mici bazate pe descoperirile acestui studiu. „Sper că vom continua și vom putea lansa companii și dezvolta molecule clinice pe baza acestei descoperiri”, a spus el.
